Agro Fossil Free - Diversità strutturale delle comunità batteriche in due suoli divergenti della rizosfera del girasole

Descrizione generale

Scopo: le pratiche agricole sui terreni agricoli mirano a migliorare i nutrienti nei campi o nelle colture, la qualità e le funzioni del suolo, nonché a incrementare e sostenere la resa delle colture; tuttavia, l'effetto della perdita di diversità ecologica e del degrado ha avuto un impatto sulle funzioni dell'ecosistema. La benefica rete rizosfera-microrganismo e la rotazione delle colture possono migliorare un ecosistema stabile. L'uso della tecnica di sequenziamento di nuova generazione aiuterà a caratterizzare l'intera specie batterica nella rizosfera del girasole rispetto ai terreni sfusi vicini. Abbiamo studiato il potenziale della struttura della comunità batterica della rizosfera del girasole e dei terreni sfusi coltivati con diverse pratiche agricole in due località geografiche nella provincia nord-occidentale del Sud Africa. Metodi: il DNA è stato estratto dalla rizosfera e dai suoli sfusi associati a piante di girasole dalla rotazione delle colture (suoli della rizosfera da Lichtenburg (LTR) e suoli sfusi da Lichtenburg (LTB) e mono-coltura (suoli della rizosfera da Krayburg (KRPR) e suoli sfusi da Krayburg (KRPB) e sequenziato utilizzando il sequenziamento dell'amplicone 16S. Sono stati utilizzati strumenti di bioinformatica per analizzare il set di dati sequenziato. Risultati: Proteobatteri e Planctomiceti dominavano la rizosfera, mentre Firmicutes e Actinobacteria erano predominanti nei terreni sfusi. Differenze significative nella struttura batterica a livello di phyla e sono stati rivelati i livelli di famiglia e le categorie funzionali previste tra i suoli (P <0,05) nei siti. È stato osservato che l'effetto dei parametri fisico-chimici influenza la dispersione batterica attraverso i siti. Conclusione: questo studio fornisce informazioni sulla struttura della comunità batterica predominante nei suoli di girasole e i loro attributi funzionali predittivi nella fase di crescita, il che suggerisce il loro studio futuro per la produzione e la gestione di colture imminenti per maggiori rese agricole.